期刊简介

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  • 杂志名称:重庆医学杂志
  • 主管单位:重庆市卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:重庆市卫生信息中心,重庆市医学会
  • 国际刊号:1671-8348
  • 国内刊号:50-1097/R
  • 出版周期:旬刊
期刊荣誉:中国科技论文统计源期刊期刊收录:CA 化学文摘(美), 剑桥科学文摘, 知网收录(中), 万方收录(中), 哥白尼索引(波兰), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 上海图书馆馆藏
重庆医学杂志2018年第24期

基于生物信息学分析肺炎链球菌LytR蛋白特征

吴凯峰;张競之;查何;刘雁;童华波;潘卫;王正蓉

关键词:肺炎, 链球菌属, 肺炎链球菌, LytR蛋白, 生物学信息学分析
摘要:目的 研究肺炎链球菌spr1759 (LytR)蛋白的基本理化性质,初步分析预测该蛋白的结构与功能.方法 利用Bioedit、TMHMM、TargetP和ExPASy等多种生物信息学软件对肺炎链球菌spr1759蛋白进行分析,并对其功能预测.利用TMHMM软件对比肺炎链球菌spr1759蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97 1211二级结构差异;利用Megalign软件分析它们之间的氨基酸序列相似性.结果 肺炎链球菌spr1759蛋白为一亲水性蛋白,其相对分子质量为37.56×103,等电点为5.11,存在1个跨膜区.肺炎链球菌spr1759蛋白属于LytR_cpsA_psr超家族,可能具有阴离子细胞壁多聚物合成相关酶的功能.与其他细菌蛋白比对发现,该蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97_1211具有相似的跨膜结构域,均含有1跨膜结构;肺炎链球菌spr1759蛋白与炭疽芽孢杆菌BAS5115蛋白和枯草芽孢杆菌DJ97_1211蛋白氨基酸序列具有较高同源性,全长序列相似性分别为35.7%和32.5%.结论 肺炎链球菌LytR蛋白是具有跨膜结构的亲水性蛋白,可能具有阴离子细胞壁多聚物合成相关酶学功能.